MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Anaplasma phagocytophilum str. Dog2 genome

Total Repeats: 22155

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021881	GCTA	2	8	55065	55072	25 %	25 %	25 %	25 %	526464735
1002	NC_021881	TA	3	6	55071	55076	50 %	50 %	0 %	0 %	526464735
1003	NC_021881	AGTA	2	8	55096	55103	50 %	25 %	25 %	0 %	526464735
1004	NC_021881	GTT	2	6	55136	55141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526464735
1005	NC_021881	GTG	2	6	55229	55234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526464735
1006	NC_021881	TTC	2	6	55314	55319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464735
1007	NC_021881	TTG	2	6	55343	55348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526464735
1008	NC_021881	TTCTA	2	10	55398	55407	20 %	60 %	0 %	20 %	526464735
1009	NC_021881	GTA	2	6	55499	55504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464735
1010	NC_021881	CTT	2	6	55508	55513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464735
1011	NC_021881	TTA	2	6	55516	55521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464735
1012	NC_021881	A	6	6	55555	55560	100 %	0 %	0 %	0 %	526464735
1013	NC_021881	ATA	2	6	55607	55612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526464735
1014	NC_021881	GCA	2	6	55642	55647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464735
1015	NC_021881	T	6	6	55663	55668	0 %	100 %	0 %	0 %	526464735
1016	NC_021881	TGA	2	6	55692	55697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464735
1017	NC_021881	CAT	2	6	55731	55736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464735
1018	NC_021881	GTT	2	6	55764	55769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526464735
1019	NC_021881	AGT	2	6	55775	55780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464735
1020	NC_021881	T	6	6	55810	55815	0 %	100 %	0 %	0 %	526464735
1021	NC_021881	ACA	2	6	55841	55846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464735
1022	NC_021881	AT	3	6	55888	55893	50 %	50 %	0 %	0 %	526464735
1023	NC_021881	A	7	7	56235	56241	100 %	0 %	0 %	0 %	526464736
1024	NC_021881	TCT	2	6	56332	56337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464736
1025	NC_021881	ATA	2	6	56498	56503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526464736
1026	NC_021881	GTCT	2	8	56507	56514	0 %	50 %	25 %	25 %	526464736
1027	NC_021881	AAT	2	6	56610	56615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526464736
1028	NC_021881	GTG	2	6	56675	56680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526464736
1029	NC_021881	GA	3	6	56684	56689	50 %	0 %	50 %	0 %	526464736
1030	NC_021881	TTC	2	6	56751	56756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464736
1031	NC_021881	ATG	2	6	56804	56809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464736
1032	NC_021881	ATCAA	2	10	56855	56864	60 %	20 %	0 %	20 %	526464736
1033	NC_021881	AAG	2	6	56944	56949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464736
1034	NC_021881	AAG	2	6	56953	56958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464736
1035	NC_021881	AT	3	6	57037	57042	50 %	50 %	0 %	0 %	526464736
1036	NC_021881	T	6	6	57044	57049	0 %	100 %	0 %	0 %	526464736
1037	NC_021881	CTG	2	6	57068	57073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464736
1038	NC_021881	CGG	2	6	57105	57110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526464736
1039	NC_021881	ATGGC	2	10	57112	57121	20 %	20 %	40 %	20 %	526464736
1040	NC_021881	AT	3	6	57136	57141	50 %	50 %	0 %	0 %	526464736
1041	NC_021881	TACTA	2	10	57205	57214	40 %	40 %	0 %	20 %	526464736
1042	NC_021881	TTC	2	6	57251	57256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464736
1043	NC_021881	AGT	2	6	57322	57327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464736
1044	NC_021881	TAA	2	6	57329	57334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526464736
1045	NC_021881	CGTT	2	8	57467	57474	0 %	50 %	25 %	25 %	526464736
1046	NC_021881	CCT	2	6	57501	57506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526464736
1047	NC_021881	GAA	2	6	57544	57549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464736
1048	NC_021881	TGA	2	6	57555	57560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464736
1049	NC_021881	CAT	2	6	57751	57756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464736
1050	NC_021881	TAC	2	6	57828	57833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464736
1051	NC_021881	GATA	2	8	57846	57853	50 %	25 %	25 %	0 %	526464736
1052	NC_021881	TTA	2	6	57875	57880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464736
1053	NC_021881	TCA	2	6	58160	58165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464736
1054	NC_021881	A	6	6	58175	58180	100 %	0 %	0 %	0 %	526464736
1055	NC_021881	AAG	2	6	58235	58240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464736
1056	NC_021881	TA	3	6	58241	58246	50 %	50 %	0 %	0 %	526464736
1057	NC_021881	CTT	2	6	58276	58281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464736
1058	NC_021881	GTC	2	6	58283	58288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464736
1059	NC_021881	CAT	2	6	58405	58410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464736
1060	NC_021881	GA	3	6	58415	58420	50 %	0 %	50 %	0 %	526464736
1061	NC_021881	ACCA	2	8	58500	58507	50 %	0 %	0 %	50 %	526464736
1062	NC_021881	AGA	2	6	58512	58517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464736
1063	NC_021881	ATG	2	6	58571	58576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464736
1064	NC_021881	GTA	2	6	58643	58648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464736
1065	NC_021881	CTT	2	6	58659	58664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464736
1066	NC_021881	TAG	2	6	58692	58697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464736
1067	NC_021881	ACAG	2	8	58867	58874	50 %	0 %	25 %	25 %	526464736
1068	NC_021881	AGA	2	6	58875	58880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464736
1069	NC_021881	GATA	2	8	58885	58892	50 %	25 %	25 %	0 %	526464736
1070	NC_021881	CAA	2	6	58914	58919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464736
1071	NC_021881	A	6	6	58931	58936	100 %	0 %	0 %	0 %	526464736
1072	NC_021881	GGA	2	6	58967	58972	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526464736
1073	NC_021881	TGC	2	6	58977	58982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464736
1074	NC_021881	TTG	2	6	59015	59020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526464736
1075	NC_021881	GCTG	2	8	59025	59032	0 %	25 %	50 %	25 %	526464736
1076	NC_021881	TGC	2	6	59039	59044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464736
1077	NC_021881	AG	3	6	59052	59057	50 %	0 %	50 %	0 %	526464736
1078	NC_021881	TGG	2	6	59088	59093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526464736
1079	NC_021881	ATTAG	2	10	59098	59107	40 %	40 %	20 %	0 %	526464736
1080	NC_021881	ATT	2	6	59274	59279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464736
1081	NC_021881	A	6	6	59396	59401	100 %	0 %	0 %	0 %	526464736
1082	NC_021881	TGC	2	6	59418	59423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464736
1083	NC_021881	T	6	6	59428	59433	0 %	100 %	0 %	0 %	526464736
1084	NC_021881	AGATGT	2	12	59505	59516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464736
1085	NC_021881	AAC	2	6	59517	59522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464736
1086	NC_021881	GTG	2	6	59564	59569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526464736
1087	NC_021881	TCAA	2	8	59615	59622	50 %	25 %	0 %	25 %	526464736
1088	NC_021881	ACA	2	6	59671	59676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464736
1089	NC_021881	CG	3	6	59682	59687	0 %	0 %	50 %	50 %	526464736
1090	NC_021881	TTC	2	6	59703	59708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464736
1091	NC_021881	TAA	2	6	59709	59714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526464736
1092	NC_021881	GTT	2	6	59761	59766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526464736
1093	NC_021881	CTG	2	6	59780	59785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464736
1094	NC_021881	GTT	2	6	59899	59904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526464736
1095	NC_021881	AT	3	6	59951	59956	50 %	50 %	0 %	0 %	526464736
1096	NC_021881	TGA	2	6	59973	59978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464736
1097	NC_021881	CAT	2	6	60019	60024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464736
1098	NC_021881	ATG	2	6	60047	60052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464736
1099	NC_021881	AGC	2	6	60060	60065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464736
1100	NC_021881	AAG	2	6	60242	60247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464736
1101	NC_021881	TCG	2	6	60293	60298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464736
1102	NC_021881	TGA	2	6	60330	60335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464736
1103	NC_021881	GAT	2	6	60352	60357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464736
1104	NC_021881	ATG	2	6	60434	60439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464736
1105	NC_021881	GGT	2	6	60505	60510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526464736
1106	NC_021881	CT	3	6	60520	60525	0 %	50 %	0 %	50 %	526464736
1107	NC_021881	TTA	2	6	60965	60970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464129
1108	NC_021881	ACA	2	6	61004	61009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464129
1109	NC_021881	GGT	2	6	61032	61037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526464129
1110	NC_021881	GGAA	2	8	61055	61062	50 %	0 %	50 %	0 %	526464129
1111	NC_021881	TGC	2	6	61067	61072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464129
1112	NC_021881	AAG	2	6	61084	61089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464129
1113	NC_021881	TA	3	6	61120	61125	50 %	50 %	0 %	0 %	526464129
1114	NC_021881	ATG	2	6	61127	61132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464129
1115	NC_021881	TGC	2	6	61241	61246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464129
1116	NC_021881	ATG	2	6	61301	61306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464129
1117	NC_021881	GTA	2	6	61342	61347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464129
1118	NC_021881	TA	3	6	61346	61351	50 %	50 %	0 %	0 %	526464129
1119	NC_021881	TTC	2	6	61434	61439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464129
1120	NC_021881	ATTG	2	8	61461	61468	25 %	50 %	25 %	0 %	526464129
1121	NC_021881	TGG	2	6	61475	61480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526464129
1122	NC_021881	AAT	2	6	61483	61488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526464129
1123	NC_021881	AG	3	6	61504	61509	50 %	0 %	50 %	0 %	526464129
1124	NC_021881	TGC	3	9	61575	61583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464129
1125	NC_021881	GGT	2	6	61594	61599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526464129
1126	NC_021881	TTC	2	6	61638	61643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464129
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1240	NC_021881	CT	4	8	68665	68672	0 %	50 %	0 %	50 %	526464135
1241	NC_021881	GCA	2	6	68676	68681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464135
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1244	NC_021881	AAG	2	6	68779	68784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464135
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1246	NC_021881	TTCCT	2	10	68863	68872	0 %	60 %	0 %	40 %	526464135
1247	NC_021881	TGC	2	6	68921	68926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464136
1248	NC_021881	CA	3	6	69004	69009	50 %	0 %	0 %	50 %	526464136
1249	NC_021881	CAG	3	9	69055	69063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464136
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